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Universidad Nacional Agraria (3494)
- Centro Nacional de Información y Documentación Agropecuaria (2)
- Dirección de Comunicación (9)
- Dirección de Cooperación Externa (3)
- Dirección de Investigación. Extensión y Posgrado (400)
- Escuela Nacional de Agricultura y Ganadería (150)
- Facultad de Agronomía (1205)
  - Departamento de Ingeniería Agrícola (4)
  - Departamento de Producción (4)
  - Departamento de Protección Agrícola Forestal (37)
  - Doctorado en Agroecología (2)
  - Doctorado en Ciencias de la Agroecología (1)
  - Ingeniería Agroindustria de los Alimentos (5)
  - Ingeniería Agronómica (845)
  - Ingeniería Agronómica Generalista e Ingeniería en Zootecnia (1)
  - Ingeniería Agronómica con especialidad en Fitotecnia (1)
  - Ingeniería Agrícola (8)
  - Ingeniería Agrícola para el Desarrollo Sostenible (57)
  - Ingeniería Sanidad Vegetal (4)
  - Ingeniería en Sistemas de Protección Agrícola y Forestal (74)
  - Maestría de Mejoramiento Genético (10)
  - Maestría en Agroecología y Desarrollo Sostenible (23)
  - Maestría en Ciencias en Innovación Agropecuaria (1)
  - Maestría en Gestión de Medidas Sanitarias y Fitosanitarias (13)
  - Maestría en Innovación Agropecuaria (4)
  - Maestría en Mejora Genética Vegetal (4)
  - Maestría en Sanidad Vegetal (39)
- Facultad de Ciencia Animal (589)
  - Departamento de Sistemas Integrales de Producción Animal (13)
  - Departamento de Veterinaria (13)
  - Ingeniería en Zootécnia (266)
  - Licenciatura en Medicina Veterinaria (238)
  - Maestría en producción animal sostenible (10)
  - Medicina Veterinaria (7)
- Facultad de Desarrollo Rural (299)
  - Departamento de Ciencias Económicas y Administrativas (1)
  - Departamento de Desarrollo Rural (10)
  - Ingeniería Agronómica (73)
  - Licenciatura en Agronegocios (87)
  - Licenciatura en Desarrollo Rural (52)
  - Licenciatura en Extensión Agraria (1)
  - Licenciatura en Turismo Rural y Comunitario (2)
  - Maestría Profesional en Seguridad Alimentaria, Nutricional y Desarrollo (3)
  - Maestría en Ciencias de los Agronegocios (9)
  - Maestría en Ciencias en Desarrollo Rural (16)
  - Maestría en Formulación, Evaluación y Gerencia en Proyectos de Desarrollo (9)
- Facultad de Recursos Naturales y del Ambiente (522)
  - Departamento de Manejo de Bosques y Ecosistemas (2)
  - Departamento de Manejo de Cuencas (7)
  - Ingeniería Forestal (169)
  - Ingeniería Forestal, con Mención en Restauración de Ecosistemas Forestales (1)
  - Ingeniería en Recursos Naturales y Renovables (74)
  - Maestría Gestión de Recurso Forestal con enfoque de Cuenca Hidrográficas (7)
  - Maestría en Ciencias de Manejo y Conservación de los Recursos Naturales Renovables (11)
- Instituto Superior de Ciencias Agropecuarias (173)
  - Escuela de Ciencias Forestales (10)
  - Escuela de Producción Animal (12)
  - Escuela de Producción Vegetal (110)
  - Escuela de Sanidad Vegetal (37)
  - Escuela de Suelos y Aguas (4)
- Oficina Técnica de Evaluación Institucional (2)
- Secretaría General (4)
- Sede Camoapa (124)
  - Ingeniería Agronómica (45)
  - Licenciatura en Administración de empresas con mención en Agronegocios (38)
  - Licenciatura en Medicina Veterinaria (41)
- Sede Juigalpa (12)
  - Ingeniería Agronómica (10)
  - Ingeniería en Zootécnia (2)

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